Problema grave no sistema.

Boa noite a todos!
Por favor, peço ajuda para quem realmente for bem avançado no quesito sistema Android.

O caso é o seguinte, eu passei meu oneplus one para meu pai, ele nunca foi atualizado por tanto está com o Android 4.4.2.
Eu havia feito root nele mas não havia nada demais no celular, até aí tudo bem.
Passei para ele e após alguns meses ele não sabe como mas o aplicativo de configurações sumiu, e todos os atalhos que levam as configurações do Android não funcionam, se eu tento por exemplo baixar um aplicativo que lida com as configurações do Wi-Fi, o aplicativo para de funcionar.... Porém eu consigo ligar e desligar o Wi-Fi, bluetooth etc pela aba de tarefas e funciona normal...

Tenho medo de formatar ele pelo hard reset e ele acusar alguma falha por falta de alguma coisa no sistema e eu perder o aparelho de vez.

Peço para me.ajudar pois o celular está ótimo, eu não consigo.instalar outra ROM, mas se alguém conseguir por mim eu posso contratar o serviço!

Fico no aguardo!